2010年7月1日 星期四

[NGS] Genome Analyzer (Solexa)

Technology Overview:

1.將碎裂後的DNA的片段(~250bp),兩端接上 adapter

2.調整濃度後,倒在表面接有OLIGO的載體上,DNA片段會隨機的黏附載體上,如果濃度得宜,一條一條的DNA會自然的分散固定在載體上

3.因DNA可以自由彎曲,所以就由固定的一端,四處碰撞直到另一端有黏到週邊的OLIGO上。

4.接下來進行合成,新的DNA會從另一端的OLIGO上合成長出來,而這個新的DNA因為Oligo 的關係,會被固定在載體上

5.Denature 雙股DNA,然後,就由一條變成兩條序列互補的DNA了。

6.幾個循環後,原來單小分子的片段,週圍就會形成一個同一序列,相互分離的叢集,一次解決分子放大及分離的兩個問題

Solexa 的放大流程少了微珠及系列選殖的成本,而目前一片晶片設計有八條載體區,每一區上最多可以生成一千萬個叢集,在數量上也量是各系統之冠。


Workflow:


Ref: http://keck.med.yale.edu/microarrays/solexa/technology.html

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